快讯|GRAIL公布循环细胞游离基因组图谱（CCGA）研究最终数据

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2021-06-26
早筛网讯：6月24日，GRAIL在欧洲肿瘤学会（ESMO）旗下期刊《肿瘤学年鉴》（Annals of Oncology）发表了循环细胞游离基因组图谱研究（Circulating Cell-free Genome Atlas，CCGA）的最终结果。


CCGA是一项前瞻性、病例对照、观察性研究，旨在开发并验证通过一管血实现多种癌症的早期检测(multi-cancer early detection,MCED)和组织溯源（cancer signal origin,CSO）。CCGA在北美142个合作诊所共招募了15254名参与者，共分为三个子项目CCGA1、CCGA2和CCGA3。


CCGA1为原理发现阶段，训练集样本1785例，验证集样本1015例，同时对三种不同的方法进行评估：1.靶向测序；2.全基因组测序（拷贝数变异，CNV）；3.全基因组甲基化。结果发现，全基因组甲基化技术路线更适合于癌症早筛。

CCGA2为试剂研发和机器学习模型构建、初步验证阶段，训练集样本3133例，验证集样本1354例。通过重亚硫酸盐测序对血浆cfDNA进行分析，靶向panel涵盖超过10万信号丰富的甲基化区域。CCGA2的研究成果主要是发现了关键的甲基化区域，训练并验证了优化后的甲基化试剂以及机器学习分类器（classifier）。

CCGA3为大规模的临床验证阶段，共纳入4077个样本，其中癌症2823例，非癌症1254例。作为CCGA最后一个子项目，CCGA3主要目的是锁定多癌早检（MCED）产品GalleriTM试剂和机器学习分类器（classifier），并在一个独立的验证集中进行验证。


CCGA3结果发现：肿瘤信号检测的特异性为99.5%[95%可信区间(CI): 99.0%至99.8%]。肿瘤信号检测的总体敏感性为51.5% (49.6% ~ 53.3%);敏感性随分期升高[I期:16.8%(14.5% ~ 19.5%)、II期:40.4%(36.8% ~ 44.1%)、II期:77.0%(73.4% ~ 80.3%)、IV期:90.1%(87.5% ~ 92.2%)]。在12种预先指定的癌症中I-III期的敏感性为67.6%(64.4% - 70.6%)，约占美国每年癌症死亡人数的三分之二，在所有癌症中为40.7%(38.7% - 42.9%)。在超过50种癌症类型中都能够检测到癌症信号。组织溯源（CSO）预测真阳性的总体准确率为88.7%(87.0% ~ 90.2%)。


在肿瘤高危人群50-79岁的受试者中，研究团队预测了该MCED测试的PPV和NPV分别为44.4%和99.4%。

GRAIL的研究团队得出结论：在这项预先指定的、大规模的临床验证亚研究中，多癌早检（MCED）方法展示了CSO预测和检测多种癌症信号的高特异性和准确性。这些结果支持了这种以血液为基础的MCED测试作为现有单一癌症筛查测试的补充的可行性。

该论文的第一作者、美国克利夫兰诊所格利克曼泌尿和肾脏研究所(Glickman Urological and Kidney Institute, Cleveland Clinic)主任埃里克·克莱因(Eric Klein)博士说:“及早发现癌症，治疗更有可能成功，这是我们减少癌症负担的最重要机会之一。这些数据表明，如果与现有的筛查测试一起使用，MCED测试可能对癌症的检测方式产生深远的影响，并最终对公众健康产生积极影响。”

CCGA的研究结果毫无疑问对GRAIL甚至对行业来说都是具有重要参考意义的，不过也有其局限性：如果在癌症患者进行活检后采集血液样本，与活检前相比，可能会增加血液中cfDNA的比例;CCGA是一项病例对照研究，可能不能完全反映该试验在人群筛查条件下的表现(GRAIL另一项研究PATHFINDER主要被设计用于评估Galleri在临床环境中的实用性和性能，数据已经公布：快讯|GRAIL公布PATHFINDER中期数据，并正式发布多癌早检产品Galleri);在检测由人类乳头状瘤病毒(HPV)引起的癌症来源组织时出现了一些不准确，例如宫颈癌、肛门癌、头颈部癌。

《肿瘤学年鉴》主编Fabrice André表示:“癌症的早期发现是癌症研究的下一个前沿领域，因为它可以挽救全世界数百万人的生命。开发解决这个问题的技术是第一步。下一步将包括开发新的治疗干预措施。与此同时，必须继续进行与提高人口意识有关的重大努力，否则所有这些努力将不会导致结果的转变。”



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