奕谱生物董世华博士:从技术到临床的转化,是实现肿瘤早筛的第一步

癌症早筛KOL100
2021-07-12

《癌症早筛KOL100》系列专访

第30期






受访嘉宾简介:董世华,博士,上海奕谱生物科技有限公司研发总监&联合创始人

博士毕业于复旦大学生物医学研究院,表观遗传学方向。擅长DNA甲基化技术的研究与转化,发现并命名了全癌DNA甲基化肿瘤标记物在肿瘤、液体活检、二代测序、生物信息学等领域有广泛兴趣,相关研究成果发表在Cancer Research、Genome Research等国际期刊。




上海奕谱生物科技有限公司作为全癌早筛的倡导者和开拓者,是一家专注于肿瘤DNA甲基化分子诊断,聚焦精准诊疗产业的高新技术企业。依托顶尖的表观遗传专家团队,奕谱生物发现了全癌标志物STAMP®,早筛网就基因甲基化技术的转化、全癌标志物STAMP®的应用等问题对公司研发总监、联合创始人董世华博士进行了专访。





能否简单介绍下奕谱生物的创立初衷?奕谱生物的定位是什么?




将DNA甲基化全癌标志物技术转化到临床,希望科学技术带来的进步能够产生实际的应用价值,为普通老百姓带来实惠,是我们创立奕谱生物的初衷。


奕谱的定位是致力于原创研发与技术转化,体现原创科学技术转化到临床的应用价值。这在国内是非常少见的,尤其是在医疗方面,缺少底层的原创技术以及可以走出国门的技术。





公司核心团队的组成是怎样的?有哪些优势?




我自己是复旦大学于文强教授的博士,博士阶段主要研究肿瘤与DNA甲基化,在奕谱担任研发总监,也是奕谱的联合创始人,加入奕谱主要是想用一身所学为社会创造价值。


奕谱CEO化琳女士,她曾是乔贝资本创始合伙人,曾任富邦金控行业研究员、国信证券上市公司部执行总经理,有十余年的企业服务经验,业务领域涵盖天使、风投、股权投资及上市公司并购重组等细分领域。化总之前是奕谱的投资人,在合作过程中对奕谱生物的技术创新性与公司文化理念的认同日益深刻,在于教授的邀请下加入奕谱。她在基金、管理、投融资等方面有丰富的经验,这对奕谱的创业团队是极大的补充,对于她的加入,我们深感荣幸。


对于奕谱的创业团队,我总结了两句话:


既毕业,再创业,躬身入局成事业;

盼人才,望君来,舍得十年创未来!


总而言之,目前奕谱的核心团队囊括了研发、检验、市场销售、企业管理等各方面人才,团队架构十分完善,人员规模也在持续扩增,我们也希望有更多优秀的伙伴能够加入奕谱这个平台,躬身入局,施展自己的抱负,真正实现自我价值,为社会做出贡献。





STAMP®经过验证,应用场景包括哪些?‍‍‍‍公司在布局早筛产品时为何选择宫颈癌和尿路上皮癌作为切入点?




STAMP全癌DNA甲基化标志物是一个非常特殊的标志物,因其在几乎所有肿瘤中高甲基化的特性,让我们可以针对许多癌种开发设计产品。奕谱自成立以来开展了非常多的临床合作,包括针对肺癌的肺泡灌洗液样本、血浆样本,针对肝癌的血浆样本,针对结直肠癌的粪便样本,针对胆道肿瘤的胆汁样本、血浆样本,针对食管癌的组织样本、血浆样本,针对胃癌的胃镜样本,针对乳腺癌的组织样本,针对宫颈癌的组织、分泌物、宫颈刮片、血浆样本,针对尿路上皮癌的尿液样本,针对宫外孕的血浆样本,针对免疫治疗的血浆样本等。


基于广泛的临床合作,一方面我们探索了STAMP®不同的应用场景,另一方面也积累了大量的临床样本,为后续的产品研发打下了坚实的基础。目前奕谱的样本库已经有超过15000+例样本,已经验证的癌种超过17种,已经验证的临床样本类型超过13种,应用场景涵盖健康人群肿瘤早筛、高危人群风险分流、有症状人群的辅助诊断、治疗过程的疗效评估、预后的复发监测等,贯穿肿瘤诊疗全流程。


通过与临床医生持续的沟通碰撞,宫颈癌早筛产品与尿路上皮癌检测产品首先研发落地。宫颈癌具有市场教育成熟、临床痛点明确、市场需求巨大等特点,而奕谱的技术从检测效果、市场需求、医生评价等方面都十分符合宫颈癌早期筛查的要求;尿路上皮癌的临床痛点非常明确,即尿路上皮癌的预后复发监测,目前并没有很好于的解决方案,而奕谱的技术可以通过尿液样本对尿路上皮癌进行预后复发监测,从而非常好地解决临床问题。


如今,奕谱的宫颈癌早期筛查与尿路上皮癌筛查产品在研发层面已经十分成熟,与多家医院展开的多中心验证正在有序进行。





在将基因甲基化检测技术投入应用的过程中有没有遇到什么困难?是如何解决的?




奕谱一路走来确实遇到了非常多的难题,经历了一路的曲折坎坷,奕谱在摸索中解决了很多的难题。在过去三年多的时间里,奕谱生物的工作主要聚焦在以下几个方面:


(1)奕谱解决的第一个难题是DNA甲基化检测流程的标准化。


把基础实验室的技术在产业化中稳定、准确地重复出来,并不是一件容易的事情。转化研究是基础研究的再创造,所以检测的流程化、可重复性、防污染、质控设置等每个环节都非常重要。因此,建立一套符合临床样本检测要求的DNA甲基化标准检测流程是我们首先要解决的问题。奕谱成立之初便致力于建立一套标准化的检测流程,经过三年多的摸索,我们已经建立了一套“临床沟通-样本采集-保存运输-建立样本库-样本前处理-核酸提取-甲基化检测-报告发送-报告解读”的标准流程,并且奕谱正在建立实验室电子化信息管理系统,希望在2021年下半年实现该系统的信息化管理。


(2)奕谱解决的第二个难题是DNA甲基化检测方法——Me-qPCR技术的开发与优化。


DNA甲基化肿瘤标志物的临床应用价值已经获得业内人士的普遍认可,但DNA甲基化在临床应用方面还面临两个重要难题:①缺少好的DNA甲基化检测靶点:公开发表的DNA甲基化标记物很多,但敏感性与特异性都比较好的并不多,能转化到临床应用的更是寥寥无几,且大部分原始专利都在国外。②缺少简便稳定的DNA甲基化检测方法:DNA甲基化检测方法是限制其临床应用的重要技术瓶颈。经典的甲基化检测方法都离不开重亚硫酸盐转化,这一方法在临床应用中因其操作复杂、时间长、假阳性率高、技术人员依赖性高等问题,导致其无法做到简便及流程化。在临床转化过程中,我们尝试建立一种新的、能够避开重亚硫酸盐处理环节的甲基化检测方法。经过大量的探索,奕谱生物开发了Me-qPCR技术,该技术具有以下优势:


  • 简便:不依赖于亚硫酸盐处理即可完成DNA甲基化检测,大大简化了DNA甲基化的检测流程,下游直接兼容荧光定量PCR技术平台。


  • 准确性高:在与焦磷酸测序的方法比较中,Me-qPCR具有优于焦磷酸测序的灵敏度,尤其对于低甲基化区间具有更好的分辨率,适用于临床检测肿瘤组分含量低的样本。


总而言之,相比于传统方法,Me-qPCR方法具有操作简便、检测时间短、可质控、仪器普适性广等优点,我们已将其应用到宫颈癌早期筛查等产品中。


(3)奕谱解决的第三个难题是硬件设施的搭建。


奕谱总部位于上海徐汇区,面积900平米,主要定位于核心技术与原创技术的研发;奕谱GMP生产中心位于上海市金山区,面积2200平,定位产品生产,预计今年9月投入使用;奕谱的第三方医检所位于山东省菏泽市,面积2500平米,定位提供第三方医学检测服务,预计今年12月份投入使用。





公司开展STAMP·紫丝带宫颈癌早期筛查公益活动的初衷是什么?进展如何?




STAMP·紫丝带活动主要在菏泽地区开展,响应菏泽政府两癌筛查的活动,为菏泽市提供10000例免费的宫颈癌筛查检测服务。我们希望通过开展这个公益活动,能够把奕谱的技术尽早地服务于广大老百姓;同时,这也是对奕谱的一场考试,因为前期的技术验证已经积累了足够的技术可靠性,现在是真正投入实际验证的时候了。我们希望通过这项公益活动,为降低菏泽市宫颈癌的发病率贡献自己的一些力量。


目前我们已经召开了活动启动会,启动会后在菏泽市政府、卫健委等相关部门的组织帮助下,与菏泽各个地区负责两癌筛查的单位建立了沟通联系,项目正在有序进行中,并且已经完成了部分样本的检测,我们希望在年底能给菏泽市政府与当地老百姓交上一份满意的答卷。





除了目前的产品和平台,公司还有哪些在研管线?未来发展方向的展望是什么?




基于全癌标志物的成熟检测体系,奕谱不断在临床应用场景方面进行产品体系的拓展。宫颈癌与尿路上皮癌是奕谱第一梯队的研发产品,后续的研发管线包括了肿瘤治疗疗效评估、胆道肿瘤等多个癌种的相关产品研发。


希望在不远的将来,奕谱生物基于DNA甲基化检测技术能够在肿瘤早筛、辅助诊断、疗效判定、复发检测等方面对多个癌种实现临床转化。也希望在不远的将来,奕谱的DNA甲基化自动化检测技术在临床上能得到广泛应用。





您认为目前肿瘤早筛市场的现状如何?前景怎么样?




我个人认为肿瘤早筛市场才刚刚起步,尤其是国内,大家都还在不同方向进行探索,还没有走出一条完整的道路。对于未来,我认为肿瘤早筛市场前进的道路是曲折的,但前途是光明的。随着技术的日趋成熟,以及老百姓对健康体检、肿瘤早筛等价值的认可度日益提高,未来肿瘤早筛市场一定具有广阔的前景。


希望有更多的人能够加入到这个行业中,共同推进,共谋发展,相信星星之火必将燎原。我也始终坚信,在未来的画卷中,奕谱必将是浓墨重彩的一笔!






关于奕谱生物



上海奕谱生物科技有限公司作为全癌早筛的倡导者和开拓者,是一家专注于肿瘤DNA甲基化分子诊断,聚焦精准诊疗产业的高新技术企业,依托顶尖的表观遗传专家团队,凭借深厚的学术积累,智造引领时代的崭新技术产品,只为将癌症消灭于萌芽之中!奕谱生物深耕癌症筛查领域,秉承“让人人远离癌症”的使命,致力于癌症的早发现、早诊断、早治疗,以提高癌症患者生存率为己任,实现全民健康!



奕谱生物官网:http://www.epiprobe.com/









关于《癌症早筛KOL100》


《癌症早筛 KOL 100》访谈栏目由早筛网、基因谷、医世象联合出品、全网发布,本栏目旨在邀请国内外肿瘤领域的专家和企业领军人物从“产、学、研、医”的不同角度,分析癌症早筛的技术路径、临床转化和产业发展面临的机遇和挑战,为行业前行和百姓福祉指明方向。如果您(个人/机构)希望在《癌症早筛 KOL 100》访谈栏目分享精彩内容,请与我们联系:


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2021年10月,首届世界肿瘤早筛大会将邀请来自全球的肿瘤早筛早检领域的产学研资医政媒各界代表分享肿瘤早筛技术和产业前沿,敬请关注。





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