
《癌症早筛KOL100》
系列专访
第49期
嘉宾简介

夏林
2023年,慧算基因迈入成立的第九个年头。成立之初,慧算基因的定位是一家生物医学大数据公司,“引领数据智能,守护生命健康”是该公司的使命。
这家由上海市产业技术研究院孵化而来的企业,在肿瘤精准诊疗领域深耕多年,现如今蓄势待发进军肿瘤早筛,不断拓展生物医学大数据的边界。
着力打造肿瘤精准诊疗知识图谱平台
2015年,国家启动三批基因检测技术应用推广示范中心建设。慧算基因借力政策东风,先后承接国家基因检测技术应用示范中心、高发肿瘤及遗传性疾病基因检测示范中心。
此后,慧算基因与上海科学院上海生物信息技术研究中心共同发起了全国首个“肿瘤液体活检多中心万人计划”,旨在通过对大规模患癌群体进行液体活检基因检测,建立起中国人群的多癌种基因突变数据库、行业标准和质控体系,目前已完成超过2万例样本的基因检测,其中超过90%为血液样本,从而构建了液体活检检测体系。
从基因检测拓展到肿瘤精准诊疗再到肿瘤早筛,慧算基因在探索生物医学大数据应用的道路上不断前进。
“挖掘数据的价值是我们的目标。”慧算基因CEO夏林表示,凭借在肿瘤诊断、用药预后方面的多年积累,慧算基因已完成超25万例肿瘤专病的数据采集、数据存储、数据解读服务,逐步构建起独有的肿瘤精准诊疗知识图谱平台,未来还将进一步探索其在癌症早筛的应用。
“我们认为,不同癌症的起源、分类各不相同,癌症早筛更是涉及生物学、医学等多种方面,作为一个复杂的知识体系,无法通过简单的二维形式体现。慧算基因尝试把携带生物标志物的细胞信号进行数字化,探寻该细胞和某种肿瘤发生的关联抑或和药物敏感的关系,并在知识网络中加以呈现,通过不断迭代升级构建出更加准确可靠的癌症预测模型,助力后续研发和临床转化工作。”夏林说道。
甲基化的“蝴蝶效应”与IVD产品研发
近年来,基因测序技术发展迅猛,测序仪国产替代浪潮兴起,测序成本持续下降,PCR实验室如雨后春笋般在各地诞生。在肿瘤精准诊疗领域深耕多年的慧算基因,看准时机切入癌症早筛赛道。
如今,癌症早筛赛道呈现群雄逐鹿、百花齐放的局面,但也面临着同质化的问题。如何走出差异化道路并实现商业化落地是众多癌症早筛企业需要突破的难点。慧算基因CEO夏林表示,“我们首先通过NLP等大数据技术筛选出性能优秀的生物标志物,利用qPCR技术进行体系优化和临床验证, 进行市场初探。在商业化落地阶段,我们会着重考虑大众对于早筛产品的价格接受度, 从而采用产品组合的方式来更加贴近市场需求。”
2022年5月,慧算基因自主研发的肠癌甲基化检测产品SMARTONCO SDC2&PRKCB基因甲基化检测试剂盒(PCR荧光探针法)完成了欧盟CE-IVD认证,并获得了由荷兰CIBG当局签发的体外诊断试剂注册许可。
夏林表示,鉴于目前国内肠癌早筛产品较多的现状,慧算基因决定走“差异化路线”,暂缓该款肠癌甲基化检测产品国内上市步伐,而主推胃癌甲基化检测产品的国内落地。
此前,慧算基因通过数据挖掘发现了具有“蝴蝶效应”的泛癌甲基化BF marker,基于此开发了应用场景丰富、市场可及性强IVD的产品。夏林认为“LDT项目相对适合于辅助诊断应用场景,但是早筛如果没有大量数据支撑,LDT是比较危险的。”在临床诊断层面,慧算基因将从MRD检测切入,验证该种癌症生物标志物的临床价值,进而运用相同的技术体系将应用场景拓展至癌症早筛领域。
守护肿瘤患者数据安全
大数据时代,保障个人数据的隐私安全,其重要性不言而喻。近年来,随着国家多项政策法规的出台,包括健康医疗在内的数据安全治理领域正式进入了有法可依的新阶段。在企业层面“首席数据保护官”一职应运而生。
首席数据保护官最早源于2018年欧盟GDPR法案,该法案规定250人以上的公司必须设置首席数据保护官。夏林是国内最早一批研究生物医学大数据的从业者,她在担任慧算基因CEO的同时,也担任首席数据保护官一职。
“谈癌色变其实说明大家对于重大疾病有一定羞耻心。”夏林认为,在癌症早筛行业,未来企业需要更加重视对于参与肿瘤早筛的人群的隐私保护。她举例说明,“两癌筛查一般在社区开展,在相对开放的环境中立即看到筛查结果,如何保护阳性人群的隐私和心理健康,都需要我们关注。”
作为聚焦肿瘤精准医疗的生物医学大数据公司,慧算基因对于数据安全十分重视,在数据的采集、储存、处理等多个环节都注重保护患者的隐私安全。
未来三至五年,慧算基因将秉持开放创新的态度,通过挖掘多组学数据搭建其自身的精准医学数据产品体系,并大力推动其精准医学数据产品开展入院业务。还将与全国优秀的科研院校与医疗机构共同开发癌症相关精准医疗项目,搭建肿瘤精准诊疗知识图谱平台,力争在癌症生物标志物研发与转化上取得更大突破。
关于慧算基因

关于《癌症早筛 KOL 100》
《癌症早筛 KOL 100》访谈栏目由早筛网、基因谷、医世象联合出品、共同发布,本栏目旨在邀请国内外肿瘤领域的专家和企业领军人物从“产、学、研、医”的不同角度,分析癌症早筛的技术路径、临床转化和产业发展面临的机遇和挑战,为行业前行和百姓福祉指明方向。

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