研究成果
如今,液体活检测试已逐渐成为癌症诊断和管理的重要工具。但目前大多研究人员仍只专注于单一生物标志物类型和一个肿瘤实体。
而在最近,HealthBioCare近期在《癌症》上发布了一个对多标志物液体活检检测的初步研究,研究通过实时qPCR分析了来自 97 名癌症患者和 作为对照的15 个健康个体,对健康与肿瘤样本进行了分类,其准确率、敏感性和特异性分别为95.4%、97.9%和80%。
研究基于液体活检建立了一个分类模型,包括DNA 突变(COSM10758、COSM18561)、cfDNA 甲基化标记(MLH1、MDR1、GATA5、SFN) 和 miRNA (miR-17-5p、miR-20a-5p、miR-21-5p、miR-26a-5p、miR-27a-3p、miR-29c-3p、miR-92a-3p、miR-101- 3p, miR-133a-3p, miR-148b-3p, miR-155-5p, miR-195-5p) ,通过多种组合就能够将健康个体和患有膀胱癌、脑癌、乳腺癌、结肠直肠癌、肺癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌和胃癌患者区分开来。
研究旨在用这种多标志物液体活检测试,来同时检测多种癌症。虽然还在初期阶段,但HealthBioCare 计划通过更大的前瞻性队列来验证这种多分析物液体活检测试的临床实用性,然后再寻求欧盟对实验室开发测试的认证批准,这也代表专注于健康干预的HealthBioCare正式进军癌症诊断领域。
miRNA的新可能
miRNA(microRNA)由于拥有稳定和丰富的特性,使它成为一种具有潜力的癌症筛查生物标记物。但在目前,对其用作癌症筛查生物标志物的研究仍处于早期阶段。
目前在DNA突变领域已经进行了大量研究,其临床效用在全世界也已经广泛确立,而对于miRNA这种新事物则仍有很大的研究空间。基因诊断公司Natera 副总裁 Alexey Aleshin说:“如果你看一下早期癌症检测领域,大多数公司至少使用两种分析物,最常见的组合是甲基化和DNA突变。”
cfDNA甲基化标记提供了有关肿瘤组织溯源的信息,在先前的研究中其用于定位未知原发性癌症和检测转移病灶,这丰富了单核苷酸多态性中的信息。
Natera在去年签了一项协议,即授权许可Aarhus大学用于结直肠癌的 DNA 甲基化,该公司计划在未来的产品中将其与自己的甲基化和循环肿瘤 DNA 技术相结合。
尽管目前Natera在癌症检测领域还不够成熟,实验和证据量不足,但Natera公司也不断地在研究癌症检测领域中 miRNA 和其他 RNA 的新数据,公司对其的发展也非常期待。
研究进程的推进和发现
可以看到,仅基于DNA突变、cfDNA 甲基化或 miRNA 的分类模型显示出较差的特异性,而如果结合所有分析标志物则在一定程度上提高了特异性,不过,敏感度却下降了。研究人员必须进行几轮计算分析,以确定有助于最终分类器的标记组合。
不过,研究人员也发现,三种不同分析物的组合可以提高分类模型的性能,每种分析物类型都提供了不同的信息并为分类模型增加了价值。
HeanlthBioCare在研究中还发现,在跨越多个器官的其他六种癌症中存在着一种称为 AR p.H875Y的前列腺癌相关雄激素受体突变。据目前所知,这也是首次报道AR p.H875Y 突变用于膀胱癌、肺癌、胃癌、卵巢癌、脑癌和胰腺癌。
HealthBioCare 目前正在计划一项更大规模的研究,先前的研究样本只有97名,因此公司打算再招募大约200名癌症患者和健康个体。
该研究的第一作者 Elena Tomeva 说:“在此项目的第二阶段,我们计划使用新方法来稳定全血中的cfDNA和 RNA,以便更好地保存和运输样品。”
为了更好地推进研究进程,HealthBioCare目前也在积极地寻求合作支持。研究服务公司 System-Biologie 就帮助资助了最近的研究,并计划继续合作,用表观遗传标记来指导基于植物提取物的癌症疗法的开发。